拥有用肉眼看见“菌”能力的少年泽木直保和青梅竹马结城萤进入农业大学所发生一连串的趣事，透过直保和其他人物的互动可以了解许多跟菌相关的知识，也因为直保的特殊能力而招惹许多事情，这次的动画中完全再现了原作里登场的100种以上细菌，一气呵成的热闹的细菌军团"酿"活动集结了CG技术的优势，描绘了非常壮烈的视觉效果。2D，3D，写实等特效，在每集动画中的片尾都有“菌剧场”，本作清新可爱，搞笑的同时也轻松的介绍了很多科普知识，各种“菌”不仅造型超萌，而且有自己的思想，还可以说话，有的口气还十分狂妄：“小心我酿了你！”。

主人公桐山零，幼时因为意外事故失去了家人，是一个背负着沉重的孤独的17岁将棋棋士。 独自居住在东京旧市镇桐山零遇见了明里、日向、桃三姐妹，少年桐山零因此发生了改变……

毫无征兆的一天，杂音（Noise）突然袭来，与以往专注攻击人类相比，此次杂音似乎更有潜在的目的。曾在射月事件立下赫赫战功的雪音克莉丝（高垣彩阳 配音）与立花响（悠木碧 配音）通力配合，击败了杂音这一波的攻势，同时意识到太古遗产所罗门之杖才是这群杂音真正的目标。另一方面，世界歌姬玛丽亚（日笠阳子 配音）受邀来日，与风鸣翼（水树奈奈 配音）联手举行直播全世界的盛大演唱会。谁知演唱会开始不久，大批杂音入侵，玛丽亚代表反政府武装组织“菲尼”向全世界宣战，并且亮出了黑色的永恒之枪。

于未来的某个时间和地方,人气歌唱组合双翼(Zwei Wing)举行了风靡万千歌迷的演唱会,岂料演唱第一首歌曲以后,会场就突然被大量谜之敌人Noise攻击.双翼的成员风鸣翼和天羽奏等不及总部发出命令,果断地展现出她们最根本的SYMPHOCAL战斗形态……其中一名歌迷立花响见证整件事的发生,亦因此牵连在内,成就了两年后完全不同的她……

被后世称作“魔法少女事变”的，炼金术士卡萝的世界解剖计划被阻止的数周之后。 立花响以最大最强的敌人为对手展开格斗，被其压倒在地任凭摆布。 面对的威胁——其名为“暑假作业”。 作为学生的本分，避无可避的命运残酷到束手无策，无情到无可抗拒。 为什么会变成这样呢？ 心灵仿佛要被碾碎一般，回首过去的响。 去了海边。也去了山上。 因为与新的朋友们做了约定，以此为理由，充分享受了各处的夏日祭，晚上也像个傻瓜一样大张着嘴仰望烟花。

想要凭借神之力，打倒神明本身的原始人偶亚当·魏萨普，被圣日耳曼等人理想的动力源——贤者之石黄金炼成过的Symphogear所“击枪”。 曾经暗中活跃的巴伐利亚光明会就此瓦解，残党也在各国机关的活跃下被逼到走投无路。 然后—— 走投无路的不只有巴伐利亚光明会。 过去的超级大国美国，也因向日本发射反应兵器一事受到谴责，被国际社会所孤立。

在原导演辰树被角川解雇后，这部全新改编的《兽之朋友》聘请了不同的演员和工作人员。

在步上与现实有着微妙差异历史的现代日本。那里存在着七位拥有巨大异能之力的“王”。他们将自己的力量分给族人们，并与族人们共同组成王族。青色结晶的秩序、暴走的赤色之炎、白银的不变光辉、以及绿色分支的变革。持有各种属性的“王”们如今—— 率领青之王族“Scepter 4”的“青之王”宗像礼司担负着众多的重责。处在“黄金之王”国常路大觉管理下的御柱塔，以及诞生了“王”的神秘圣遗物——德累斯顿石盘，如今也处在宗像礼司的管辖下。此外，再加上由于杀死先代“赤之王”周防尊而产生的“弑王”的负担。 另一方面，赤之王族“吠舞罗”的族人栉名安娜，经历绿之王族“jungle”发动的御柱塔袭击之后，作为新的“赤之王”而觉醒，与“吠舞罗”的同伴们再度结下强固的羁绊。 此外，白银的族人NEKO和夜刀神狗朗坚信“白银之王”伊佐那社仍然存活，寻找着他的下落。 但寻找“白银之王”的并不只有他们而已。“绿之王”比水流也在寻找—— 以活性化的“jungle”的行动为契机，“王”们的命运再度重合。

拥有28万人口的三门市，其境内某天突然打开了一扇通往未知世界的大门。从大门的另一端，被称为“近界民”的怪物蜂拥而出。人类惊慌失措之余发现，地球现有的武器对近界民完全没有任何效果。危急时刻，神秘团体境界防卫组织“BORDER”出现击退近界民，三门市总算回归往昔的正常生活。如是过了四年半的时间，隐藏着作为“BORDER”成员身份的初中学生三云修（梶裕贵 配音）和转学生空闲游真（村中知 配音）相遇，而对方竟然是来自门另一头的近界民，此行的目的是为了找到自己的父亲。分出不同阵营的二人，注定要在命运的战争中激烈碰撞……

盖被发现已经过了人生的终点。但他仍然拥有人类的灵魂和意志。他能否打败已成为活生生武器的昔日战友.