一天，小女孩丽丽（西村千奈美配音）和爸爸妈妈来到一家以青蛙为主题的游乐园玩，在误打误撞之来到了青蛙之国，中拔出了青蛙城堡里的勇者之剑，并且打倒了大蛇。在传说中，用勇者之剑打倒大蛇的勇者将被允许实现任何的愿望。丽丽见到了青蛙王国的统治者，在国王将青蛙卵孵化之前，丽丽必须找到将希望之门打开的方法，如果没能在时限前完成任务的话，丽丽将被变成青蛙，永远的留在这个世界中。在这里，丽丽邂逅了一个名叫近藤的古怪男人，近藤总是主动接近丽丽，并且想要成为他的弟弟，这个男人真正的意图究竟是什么呢？

经过重重磨难，健四郎和尤莉亚终于迎来相聚的一刻，但是他们的时间所剩无几，在尤莉亚的请求下，健四郎开始讲述这些年来的故事：作为最强杀人拳——北斗之拳的唯一继承人，健四郎和爱人尤莉亚正准备展开新的生活。然而适值乱世，愚蠢的统治者亲手毁灭了原本的文明，活下来的人为了生存而选择暴力，杀戮成为当下的唯一准则。健四郎和尤莉亚遭遇南斗水鸟拳的阿殉，为了得到心爱的女人，阿殉不择手段，更在健四郎的胸口留下七个伤疤。痛失爱人，健四郎迎来生命的第一重磨难…… 　　本片根据原哲夫、武论尊的经典漫画原著《北斗神拳（北斗の拳）》，是《真救世主传说 北斗神拳》的第五部。